Chính phủ Nhật Bản hầu như không chi bất cứ khoản nào cho hệ thống giáo dục của mình
Nhật Bản nằm trong số 1/4 quốc gia có mức chi tiêu cho giáo dục trên GDP thấp nhất trong các nước OECD. Năm 2018, Nhật Bản chi 4% GDP cho các cơ sở giáo dục từ tiểu học đến đại học, so với mức trung bình 4,9% ở các nước OECD. Mặt khác, 30% chi phí giáo dục ở Nhật Bản được trả bởi các cá nhân, trong khi mức trung bình của OECD là 16%. Về chi tiêu cho giáo dục đại học, tỷ lệ tương ứng là 66% và 31%. Tại Nhật Bản, sinh viên đại học công lập phải trả 820.000 yên trong năm đầu tiên và khoản thanh toán cho sinh viên đại học tư nhân là 1.310.000 yên. Nhiều sinh viên không có lựa chọn nào khác ngoài việc phụ thuộc vào các khoản vay sinh viên để trang trải học phí và chi phí sinh hoạt.
Nhật Bản không đầu tư quá nhiều cho hệ thống giáo dục của mình. Con số này thấp hơn một điểm phần trăm so với các nước phát triển khác và là kết quả của việc chi tiêu tiết kiệm của Nhật Bản. Ví dụ, chính phủ Nhật Bản đầu tư vào các tòa nhà trường học đơn giản hơn là những tòa nhà trang trí. Đất nước này cũng yêu cầu sách giáo khoa bìa mềm và ít quản trị viên trong khuôn viên trường hơn. Cuối cùng, sinh viên và giảng viên lo việc dọn dẹp trường học, do đó không cần người lao công. Chính phủ Nhật Bản thực hiện như bãi bỏ chương trình giáo dục miễn phí cho các trường trung học công lập, giới hạn thu nhập đối với học phí.