Nền tảng của Nhà thờ đã từng là một thành phố ngoại giáo
Nhà thờ Đức Bà được xây dựng trên tàn tích của một thành phố ngoại giáo một thời. Được xây dựng tại nơi có thành phố Lutetia thời Gallo-La Mã từng đứng, nền móng của Nhà thờ Đức Bà đã đổi chủ một vài lần trước khi bắt đầu xây dựng nhà thờ nổi tiếng. Nó bắt đầu như một ngôi đền thờ thần Jupiter trước khi được chuyển đổi thành một nhà thờ theo phong cách Romanesque. Cuối cùng, cấu trúc cũ đã bị gỡ xuống và nền móng của nó (cùng với một số tác phẩm điêu khắc của nó) đã được sử dụng lại để xây dựng Nhà thờ Đức Bà.
Bốn công trình kiến trúc Cơ đốc giáo được cho là đã kế vị Đền thờ Pagan với Sao Mộc trước Nhà thờ Đức Bà. Đầu tiên là Vương cung thánh đường Saint Etienne có từ thế kỷ thứ 4, sau đó là công trình cải tạo theo kiểu Merovingian, sau đó được tu sửa lại thành Nhà thờ vào thế kỷ thứ 9. Sau đó, có một cuộc tu sửa khác của các cấu trúc trước khi lên đến đỉnh cao là Nhà thờ Đức Bà. Cấu trúc cuối cùng trước khi Nhà thờ Đức Bà bị phá bỏ và vật liệu của nó được tái chế để xây dựng Nhà thờ Gothic. Đền thờ Pagan tại địa điểm này đã nhường chỗ cho các Nhà thờ Thiên chúa giáo, biểu thị một sự chuyển đổi mang tính thời đại.